FortiGateへの接続をMACアドレスを登録しているPCのみに制限したいのですが
どのような設定方法で実現できますでしょうか?
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ファイアウォールポリシーにて、 MAC アドレスを指定する機能がございます。
メーカドキュメントをご案内いたしますので、詳細につきましては、
以下をご確認くださいますようお願いいたします。

■Administration Guide(FortiOS 6.4.8) MAC addressed-based policies
https://docs.fortinet.com/document/fortigate/6.4.8/administration-guide/407159/mac-addressed-based-policies