シグニチャーを更新する場合は、FortiGateがインターネットに接続されている必要がございます。

対応方法としては、FortiManagerを導入しFortiManagerでシグニチャーをダウンロードする事でFortiGateに展開する事が可能です。
ただ、FortiManagerはインターネット環境に接続されている必要がございます。